Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEBLO76041 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEBLO76041 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEBLO76041 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEBLO76041 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEBLO76041 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms