Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms