Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms