Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD4O60885 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRD4O60885 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD4O60885 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD4O60885 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD4O60885 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD4O60885 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD4O60885 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD4O60885 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD4O60885 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD4O60885 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD4O60885 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD4O60885 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD4O60885 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD4O60885 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD4O60885 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD4O60885 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD4O60885 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD4O60885 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD4O60885 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD4O60885 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD4O60885 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD4O60885 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms