Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC41.95■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC41.95■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC41.94■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
ABCC9O60706 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms