Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSCO60682 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSCO60682 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSCO60682 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSCO60682 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSCO60682 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSCO60682 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSCO60682 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSCO60682 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSCO60682 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSCO60682 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSCO60682 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSCO60682 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSCO60682 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSCO60682 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSCO60682 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms