Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GMDSO60547 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GMDSO60547 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GMDSO60547 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GMDSO60547 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GMDSO60547 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GMDSO60547 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GMDSO60547 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GMDSO60547 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GMDSO60547 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMDSO60547 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms