Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRC1O43663 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRC1O43663 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRC1O43663 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRC1O43663 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRC1O43663 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRC1O43663 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRC1O43663 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRC1O43663 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRC1O43663 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRC1O43663 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRC1O43663 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRC1O43663 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRC1O43663 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRC1O43663 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRC1O43663 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRC1O43663 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRC1O43663 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRC1O43663 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRC1O43663 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRC1O43663 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRC1O43663 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRC1O43663 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRC1O43663 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRC1O43663 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms