Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.6 ms