Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSI1O43347 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSI1O43347 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSI1O43347 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI1O43347 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI1O43347 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI1O43347 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI1O43347 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI1O43347 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI1O43347 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI1O43347 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSI1O43347 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSI1O43347 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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MSI1O43347 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSI1O43347 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI1O43347 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI1O43347 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI1O43347 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI1O43347 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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MSI1O43347 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI1O43347 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI1O43347 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSI1O43347 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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MSI1O43347 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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MSI1O43347 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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MSI1O43347 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSI1O43347 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSI1O43347 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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