Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTIFO43310 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTIFO43310 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTIFO43310 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTIFO43310 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTIFO43310 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms