Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPAA1O43292 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms