Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms