Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITO14578 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITO14578 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CITO14578 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITO14578 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITO14578 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CITO14578 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CITO14578 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CITO14578 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CITO14578 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CITO14578 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CITO14578 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CITO14578 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CITO14578 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CITO14578 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CITO14578 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CITO14578 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CITO14578 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CITO14578 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CITO14578 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CITO14578 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms