Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F3O00716 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F3O00716 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2F3O00716 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F3O00716 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F3O00716 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F3O00716 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F3O00716 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F3O00716 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F3O00716 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F3O00716 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F3O00716 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F3O00716 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F3O00716 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F3O00716 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms