Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX39AO00148 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39AO00148 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms