Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H7C1D1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H7C1D1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H7C1D1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H7C1D1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C1D1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C1D1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C1D1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C1D1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C1D1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C1D1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C1D1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H7C1D1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
H7C1D1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
H7C1D1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
H7C1D1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H7C1D1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H7C1D1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H7C1D1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C1D1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C1D1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C1D1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C1D1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H7C1D1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms