Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA8SH3BPF8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms