Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT4C9JH25 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT4C9JH25 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms