Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DEV8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B4DEV8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B4DEV8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
B4DEV8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
B4DEV8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B4DEV8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B4DEV8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DEV8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms