Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms