Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BECN2A8MW95 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms