Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms