Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCNX2A6NKB5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms