Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMX3A6NHT5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMX3A6NHT5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms