Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3AA6NCI4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms