Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSDA5PKW4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms