Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms