Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPDC1A2A3K4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms