Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F8A0AVK6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms