Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA3Q9Y6H8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms