Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF1Q9Y6D6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF1Q9Y6D6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF1Q9Y6D6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF1Q9Y6D6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF1Q9Y6D6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF1Q9Y6D6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF1Q9Y6D6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF1Q9Y6D6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms