Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms