Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB12Q9Y5F1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms