Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUPT16HQ9Y5B9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.58■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUPT16HQ9Y5B9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms