Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP15Q9Y4E8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms