Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms