Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms