Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms