Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms