Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms