Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC5Q9UQL6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms