Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHA12Q9UN75 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms