Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHTF1Q9UMS5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms