Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
INO80Q9ULG1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
INO80Q9ULG1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms