Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALD1Q9ULE6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms