Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ADAM28Q9UKQ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms