Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms