Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms