Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA2Q9UJY4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA2Q9UJY4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA2Q9UJY4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA2Q9UJY4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA2Q9UJY4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA2Q9UJY4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA2Q9UJY4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGA2Q9UJY4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GGA2Q9UJY4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms